เมื่อวันที่ 23 พย. 2554 ศาลปกครองสงขลา มีคำสั่งให้กองทัพบก แม้ทำงานภายใต้ กอ.รมน. กองทัพบกต้นสังกัด ต้องรับผิดจ่ายค่าเสียหาย ในมูลละเมิดต่อนักศึกษายะลาสองคนที่ฟ้องโดยจ่ายเงินจำนวน 250,000 บาทต่อคน กรณีควบคุมตัว 9 วันเกินอำนาจของกฎอัยการศึก และเชื่อว่าบาดแผล และบันทึกแพทย์ยืนยันได้ว่าผู้ฟ้อง (นักศึกษายะลา) ถูกทำร้ายร่างกายระหว่างการถูกควบคุมตัวของเจ้าหน้าที่ทหาร แต่จ่ายค่ารักษาพยาบาลเพียง 5000 บาท ในรายที่มีบันทึกแพทย์
เป็นคดีแรกที่ศาลปกครองเข้ามามีส่วนในการถ่วงดุลการใช้อำนาจ พิเศษในสถานการณ์พิเศษในจังหวัดชายแดนใต้ มีประเด็นที่ต้องอุทธรณ์เนื่องจากศาลปกครองฯ ยังไม่เห็นด้วยกับคำขอของผู้เสียหายเรื่องศักดิ์ศรีความเป็นมนุษย์ ค่าเสียหายทางด้านจิตใจ การสูญเสียโอกาสทางสังคม